Исследование микробиома зубов и дёсен — шесть ответов о полости рта и план от пародонтолога

Отчёт по образцу слюны в личном кабинете: шесть разделов — кариес-профиль, дёсны (пародонтит и гингивит), свежесть дыхания, афты и язвы слизистой, импланты (индекс PiRC-9), баланс сообщества. По кариесу и пародонтиту — оценка модели по всему сообществу; по каждому разделу — маркерные таксоны: обнаружены или нет, у частых — дециль относительно 10 000 образцов слюны; под каждым сработавшим маркером — что это может означать и что делать, со ссылками на исследования. В уровне «Микробиом + ДНК» — ДНК-часть отдельным разделом единого заключения Genotek: «Как ваша ДНК формирует среду во рту» и особенности слюны и слизистой. В «Персональной стоматологии» — онлайн-разбор стоматолога-пародонтолога и один документ с планом.

Нет. Исследование показывает состояние экосистемы полости рта: насколько микробиом смещён к состояниям, связанным с кариесом, воспалением пародонта и запахом. Кариес, гингивит, пародонтит и периимплантит ставит стоматолог после осмотра. Если маркеры дёсен выше типичного диапазона, отчёт говорит, что проверить у врача: осмотр с оценкой пародонта и профгигиена. Оценка модели — «типичный профиль» или «профиль ближе к кариесу / к пародонтиту», без процентов; сама по себе она рекомендаций не даёт — в отчёте прямо написано, что результат модели не является клиническим диагнозом и читается только вместе с осмотром.

Тем, что одна бактерия почти ничего не говорит. P. gingivalis и другие «таксоны болезни» встречаются и у здоровых людей; кариес — не инфекция одним микробом, а свойство целого сообщества. Поэтому здесь читается всё сообщество (shotgun): виды и роды, их доли относительно 10 000 образцов слюны, разнообразие и две оценки модели по всему сообществу. Строка маркера в отчёте выглядит так: «Streptococcus mutans — таксон не обнаружен» или «Actinomyces — дециль 6 из 10, типичный диапазон»; текст-пояснение появляется только у сработавшего маркера.

Микробиом показывает, что сложилось сейчас, но не объясняет, почему именно так. Часть ответа — в наследственности: FUT2 задаёт, какие углеводные структуры есть на слизистой и в слюне и какие микроорганизмы получают от них преимущество, AMY1 — сколько копий гена слюнной амилазы и, значит, как крахмал перерабатывается уже во рту; TAS2R38, VDR и MBL2 описывают вкус, ответ тканей на витамин D и защиту слизистой. Это исходные особенности: они не меняются, и повторять ДНК-часть не нужно; читается она из той же пробирки слюны, отдельной пробы не нужно. Формулировка результата честная: «ваш вариант связан со статистическими различиями состава микробиома» — без поиска одного гена на все случаи, и без процентов.

ДНК-часть не меняется и не говорит, что происходит во рту сегодня. Кариес и воспаление дёсен — про сообщество, которое сложилось при вашей наследственности, вашем питании, гигиене, курении и лечении, — и его можно измерить только напрямую. Кроме того, надёжных полигенных оценок кариеса и пародонтита пока нет: исследования дают разнородные результаты, и в отчёт они попадут только после собственной валидации. Поэтому ДНК-часть здесь — слой «исходные особенности», а микробиом — слой «настоящее». Именно микробиом можно повторить через 3–6 месяцев и увидеть, что изменилось после лечения или смены привычек.

Под каждым сработавшим маркером в отчёте — рекомендация со ссылками на исследования: что это может означать и что делать. Из них стоматолог-пародонтолог в «Персональной стоматологии» собирает план из трёх шагов. Первый: если маркеры дёсен выше типичного диапазона — записаться на осмотр с оценкой пародонта, и в плане написано, что именно просить проверить. Второй: снизить частоту сахарных экспозиций — для эмали важна не масса сахара, а сколько раз за день она встречается с кислотой; сладкое за один раз с едой, между приёмами — вода. Третий: не пытаться «убить плохие бактерии», а менять условия, при которых сложился дисбиоз: сухость во рту, курение, межзубная гигиена. Врач остаётся на связи.

Как правило, нет — и часто это первое, что покупают после отчёта. Многие микроорганизмы из «профиля болезни» есть и у здоровых; дело не в их присутствии, а в сочетании и условиях. Антибактериальный ополаскиватель и антибиотик убирают всё подряд на пару недель, а условия остаются — и сообщество возвращается к прежнему. Пробиотики для полости рта пока не показали устойчивого эффекта. Антибиотики и ополаскиватели курсом назначает стоматолог после осмотра, когда для этого есть причина. Задача исследования — показать, какие условия менять: частоту сахара, сухость во рту, гигиену между зубами, курение.

На приёме в клинике «Семейная стоматология Михаила Агами» (Москва, Наставнический пер., 17) или в партнёрской клинике — это занимает пять минут. Слюну собираете в пробирку — это всё, что нужно для исследования. Домой набор не отправляем: правильный забор и быстрая передача в лабораторию — часть точности результата. ДНК-часть в уровнях «Микробиом + ДНК» и «Персональная стоматология» — из той же пробирки слюны, отдельной пробы не нужно; в заключении она идёт отдельным разделом. Анкета заполняется онлайн и обязательна — без неё результат не раскладывается на три слоя.

Так же часто, как вы проходите профессиональную гигиену — обычно раз в полгода. Микробиом меняется вместе с гигиеной, питанием, лечением и курением, поэтому один результат — это точка отсчёта, а повтор показывает, что действительно изменилось: изменились ли оценки модели и децили маркерных таксонов, сдвинулось ли разнообразие сообщества. Повтор удобно совместить с плановым визитом в клинику: слюну сдаёте на том же приёме, а врач потом сопоставит профиль с тем, что видел на осмотре. ДНК-часть повторять не нужно — гены не меняются.

Индекс PiRC-9 по слюне: девять бактерий, связанных с воспалением вокруг имплантов, — перцентиль относительно 10 000 образцов слюны («сдвиг не выражен», «умеренный» или «выраженный») и «обнаружено N из 9». Раздел рассчитывается по слюне у всех: если импланты есть — это ваш показатель, если нет — справочно. Отметьте импланты в анкете — врач прочтёт раздел с учётом этого. Результат — не диагноз периимплантита, а точка отсчёта: что проверить у стоматолога и с чем сравнить через полгода.

В клинике. Продукт разработан совместно с клиникой «Семейная стоматология Михаила Агами» (AMBC, Москва): слюну сдают на приёме там или в другой партнёрской клинике, а после — там же обсуждают результат со стоматологом-пародонтологом и сразу проходят осмотр с оценкой пародонта и профессиональную гигиену, если они в плане. Онлайн-часть при этом остаётся: результат и заключение приходят в личный кабинет, разбор можно пройти по видео. Если вы стоматологическая клиника и хотите стать партнёром программы — напишите на nast@ambc.ru.